Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EBF1Q9UH73 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF1Q9UH73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms