Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN2A-AS1Q9UH64 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN2A-AS1Q9UH64 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms