Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT8Q9UFF9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT8Q9UFF9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms