Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM10Q9UDY6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM10Q9UDY6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms