Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG4Q9UBN1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG4Q9UBN1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG4Q9UBN1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNG4Q9UBN1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms