Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HACD3Q9P035 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HACD3Q9P035 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms