Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMCD1Q9NZU5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMCD1Q9NZU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms