Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYOFQ9NZM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYOFQ9NZM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms