Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SACSQ9NZJ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SACSQ9NZJ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms