Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLGN3Q9NZ94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms