Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6AQ9NYA3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms