Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDE1Q9NXR1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NDE1Q9NXR1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms