Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A12Q9NXJ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms