Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRMT1Q9NXH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT1Q9NXH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms