Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3BQ9NW08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3BQ9NW08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms