Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NLE1Q9NVX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NLE1Q9NVX2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLE1Q9NVX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLE1Q9NVX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NLE1Q9NVX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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