Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL11Q9NVR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms