Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC17Q9NVM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC17Q9NVM6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms