Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP3Q9NV31 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP3Q9NV31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms