Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATG3Q9NT62 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATG3Q9NT62 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATG3Q9NT62 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms