Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TREX1Q9NSU2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREX1Q9NSU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREX1Q9NSU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms