Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CENPMQ9NSP4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms