Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT84Q9NSB2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT84Q9NSB2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms