Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HELLSQ9NRZ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HELLSQ9NRZ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HELLSQ9NRZ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms