Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGEF4Q9NR80 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGEF4Q9NR80 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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