Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3GLB2Q9NR46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3GLB2Q9NR46 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GLB2Q9NR46 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GLB2Q9NR46 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3GLB2Q9NR46 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms