Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLE4Q9NR33 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLE4Q9NR33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms