Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDH12Q9NPG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDH12Q9NPG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDH12Q9NPG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms