Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVK-5Q9HDB9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-5Q9HDB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms