Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF2Q9HAK2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EBF2Q9HAK2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms