Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPCSQ9HAB8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPCSQ9HAB8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms