Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VIPAS39Q9H9C1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms