Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SUDS3Q9H7L9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUDS3Q9H7L9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms