Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA6BQ9H3T3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA6BQ9H3T3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA6BQ9H3T3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms