Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF39Q9H2S5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF39Q9H2S5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF39Q9H2S5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms