Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOBPQ9H2D6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOBPQ9H2D6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOBPQ9H2D6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms