Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MED28Q9H204 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MED28Q9H204 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms