Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG10Q9H0Y0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms