Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2J2Q9GZM3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR2J2Q9GZM3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR2J2Q9GZM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms