Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER1Q9C0I3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER1Q9C0I3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER1Q9C0I3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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