Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC2Q9C0B9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms