Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM55Q9BYV6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms