Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLDIP3Q9BY77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms