Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA16Q9BXB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA16Q9BXB7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms