Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP4Q9BWG4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms