Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFC1Q9BW19 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIFC1Q9BW19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms