Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN3Q9BTN0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRFN3Q9BTN0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRFN3Q9BTN0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms