Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms