Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM2D3Q9BRN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM2D3Q9BRN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms