Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SRSF8Q9BRL6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms